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  • MLST group - Multilocus sequence typing set

    Clicking on an Isolate name will bring up other alternate strain designations.

    Isolate O H Host Locale Date Notes
     1  E2348/69  127  6  human (child)  UK (Taunton)  1969  Model EPEC organism
     2  DEC1a  55  6  human (infant)  USA (Pa.)  1956  ID outbreak CDC 572-56
     3  DEC2a  55  6  human (infant)  Congo  1962  diarrhea CDC 3787-62
     4  93-111  157  7  human  USA (Wash.)  1993  1993 Washington outbreak
     5  OK-1  157  7  human  Japan (Okayama)  1996  1996 Okayama, Japan outbreak
     6  493/89  157  -  human (child)  Germany  1989  SF O157:H-, HUS outbreak
     7  5905  55  7  food (meat)  no data  1994  stx2+ O55:H7
     8  DEC5D  55  7  human  Sri Lanka  1965  diarrhea C586-65
     9  DEC8b  111  8  human  USA (Idaho)  1986  HC rpoS lesion CDC 3030A-86
     10  CL-37  111  8  human  Canada  1982  HUS
     11  DEC9F  26  NM  human  USA (S.Dak.)  1974  diarrhea CDC 2666-74
     12  DEC11a  128a  2  human  USA (Mont.)  1975  diarrhea CDC 2254-75
     13  DEC12a  111  2  human (infant)  UK  1950  DEC12a, diarrhea SSI F1-50
     14  DEC12f  111  NM  human  USA (Wash.)  1983  diarrhea outbreak CDC B170
     15  90-1787  X03  NM  cow  Canada (Ontario)  no data  bovine stx2+
     16  CL-3  113  21  human  Canada  1980  HUS
     17  B2F1  91  21  human  Canada  1985  HUS, mucous activated STX
     18  G5506  104  21  human  USA (Mont.)  1994  BD outbreak in Montana
     19  921  111  9  human  Finland  1987  diarrhea outbreak
     20  536  6  31  human  no data  no data  Model UTI, PAI
     21  DEC6A  111  21  human (infant)  USA (N.J.)  1966  
     22  9084-83  111  NM  human  Peru  1983  
     23  75-83  145  NM  human  USA (S.Dak.)  1982  
     24  395-2  26  NM  Human (F 43y)  USA (R.I.)  1994  
     25  3408-67  S. b  ND  human (F 9m)  USA (Md.)  1967  
     26  202-72  124  30  food (cheese)  no data  1972  
     27  3615-53  S. b  ND  human  Vietnam (Hanoi)  1953  
     28  RS218  18  no data  human  no data  no data  
     29  EDL-933  157  7  food (hamburger)  USA (Mich.)  1982  
     30  DEC5B  55  7  human (infant)  USA (Fla.)  1979  
     31  1181-83  142  6  human  Brazil  1983  
     32  277-84  119  6  human  USA (Ohio)  1984  
     33  TB227C  86  34  human  USA (Wash.)  1991  
     34  TB285A  26  2  human  USA (Wash.)  1991  
     35  042  44  18  human (child)  Peru (Lima)  1983  
     36  LT-82  167  -  human  Brazil  1981  
     37  LT94  164  -  human  no data  no data  
     38  LT-99  152  -  no data  no data  1968  
     39  3007-85  111  NM  human (M, 67y)  USA (Nebr.)  1985  
     40  412/55  111  no data  human  Germany  1955  
     41  6:38  103  N  human  USA (Fla.)  1997  
     42  413/89-1  26  -  cow (calf,feces)  Germany (Bavaria)  no data  
     43  E851/71  no data  no data  no data  no data  no data  
     44  3215-99  111  8  human (F, 18y)  USA (Tex.)  1999  
     45  DA-5  121  [19]  human (F, 51y)  USA (Mass.)  1998  
     46  DA-10  26  NM  human (62y F)  USA (Mass.)  1998  
     47  K-12  no data  no data  no data  no data  no data  
     48  MT#2  121  19  human  USA (Mont.)  1998  
     49  MT#80  103  2  human  USA (Mont.)  1999-2000  
     50  Sakai  157  7  human  Japan  1996  

    More Data on this strain set.

    Contact stec@cvm.msu.edu
    Operated by Shannon D. Manning at Michigan State University